由于临床上肠炎分为急性肠炎和慢性肠炎。两者症状上有差异，因此治疗上也有所差异：
①对于急性肠炎来说，其主要症状为发热、腹部疼痛、呕吐、泄泻食欲减退等表现，因此它的治疗主要采用对症治疗，轻症可口服肠道益生菌、蒙脱石散等止泻措施，当然病情较重的应该及时到医院就诊，必要时予以补液等治疗措施。
②对于慢性肠炎来说，其主要表现为反复腹痛、泄泻，严重者可出现发热和营养不良的表现。另外也有特殊的炎症性肠病、肠结核等肠炎。因此治疗上，对于肠结核的患者就需要行抗结核治疗，而对于炎症性肠病则以水杨酸类药物为主要治疗药物，当然还可以用糖皮质激素或免疫抑制剂等治疗措施。
